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dc.contributor.advisorOrjeda Fernández, María Gisella
dc.contributor.authorCaycho Ortiz, Esteban Nicolás
dc.date.accessioned2023-06-16T20:36:33Z
dc.date.available2023-06-16T20:36:33Z
dc.date.issued2023
dc.identifier.citationCaycho, E. (2023). Ensamblaje, anotación y análisis del genoma cloroplastidial del árbol de algarrobo Neltuma pallida (subfamilia: Caesalpinioideae). [Tesis de pregrado, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Facultad de Ciencias Biológicas, Escuela Profesional de Genética y Biotecnología]. Repositorio institucional Cybertesis UNMSM.es_PE
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12672/19768
dc.description.abstractEl algarrobo Neltuma pallida (Subfamilia: Caesalpinioideae), es una especie arbórea que crece en suelos áridos en el norte del Perú. Siendo predominante de la ecorregión del Bosque Seco, tiene una alta importancia económica para las personas, y ecológica para ambiente en el que se encuentra. A pesar de esto, la especie se encuentra gravemente amenazada y son pocos estudios a nivel genético y genómico en la especie, por lo que se ve limitada la posibilidad de desarrollar ciertas investigaciones. En este trabajo se secuenció el ADN de un ejemplar sano de N. pallida. A partir de este ADN se ensambló, anotó y analizó el genoma cloroplastidial de la especie, comparándolo con especies relacionadas. El genoma ensamblado fue de 162381 pb con una estructura clásica cuatripartita (LSC-IRA-SSC-IRB). Se anotaron 132 genes, de los cuales 19 eran duplicados y 18 contenían por lo menos un intrón en su secuencia. El contenido de GC calculado para el genoma fue de 35.97%, aunque esto era variable entre las regiones, encontrándose mayor en las IRs. Se identificaron una gran cantidad de secuencias repetitivas de diferentes tipos en el genoma ensamblado. Las más frecuentes fueron las repeticiones en tándem (> 300), sobre todo los microsatélites (142). La reconstrucción filogenética del género Prosopis s.l. utilizando la secuencia del genoma cloroplastidial de 6 especies mostró monofiletismo dentro del género. Neltuma pallida, mostró cercanía con P. cineraria, N. juliflora y N. glandulosa, formando un subclado con estas especies. Al comparar las secuencias del genoma cloroplastidial de N. pallida con P. cineraria y N. juliflora, se encontró que las secuencias eran muy similares, resaltando el alto nivel de conservación de este tipo genoma en el clado. En conclusión, el genoma ensamblado muestra una clásica estructura cuatripartita con 132 genes y una gran cantidad de secuencias repetitivas.es_PE
dc.description.sponsorshipPerú. Universidad Nacional Mayor de San Marcos. Vicerrectorado de Investigación y Posgrado. Programa de Proyectos de INVESTIGACIÓN para Grupos de Investigación. RR N° 01686-R-20, Código: B20100311.es_PE
dc.formatapplication/pdfes_PE
dc.language.isospaes_PE
dc.publisherUniversidad Nacional Mayor de San Marcoses_PE
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccesses_PE
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/es_PE
dc.sourceUniversidad Nacional Mayor de San Marcoses_PE
dc.sourceRepositorio de Tesis - UNMSMes_PE
dc.subjectGenética vegetales_PE
dc.subjectAlgarrobo - Perúes_PE
dc.titleEnsamblaje, anotación y análisis del genoma cloroplastidial del árbol de algarrobo Neltuma pallida (subfamilia: Caesalpinioideae)es_PE
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesises_PE
thesis.degree.nameBiólogo Genetista Biotecnólogoes_PE
thesis.degree.grantorUniversidad Nacional Mayor de San Marcos. Facultad de Ciencias Biológicas. Escuela Profesional de Genética y Biotecnologíaes_PE
thesis.degree.disciplineGenética y Biotecnologíaes_PE
dc.subject.ocdehttps://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.10es_PE
dc.publisher.countryPEes_PE
renati.advisor.dni10839204
renati.advisor.orcidhttps://orcid.org/0000-0003-3013-5523es_PE
renati.author.dni70782158
renati.discipline919036es_PE
renati.jurorRamirez Malaver, Jorge Luis
renati.jurorVivas Ruiz, Dan Erick
renati.jurorSandoval Peña, Gustavo Adolfo
renati.levelhttps://purl.org/pe-repo/renati/level#tituloProfesionales_PE
renati.typehttps://purl.org/pe-repo/renati/type#tesises_PE
sisbib.juror.dni43352480
sisbib.juror.dni41951131
sisbib.juror.dni41020762


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