Diversidad genética de poblaciones del cuy doméstico nativo Cavia porcellus (Linnaeus, 1758) en dos regiones de los Andes centrales peruanos

Abstract

El cuy es un roedor nativo de América del Sur usado como fuente de proteína, animal de compañía, en rituales y como organismo modelo. Su crianza contribuye a la seguridad alimentaria tanto en zonas rurales como en zonas urbanas del Perú. Las investigaciones en nuestro país se han enfocado en aspectos sanitarios y de zootecnia; mientras que el conocimiento a nivel genético ha sido poco abordado. Por ello esta tesis tiene como objetivo evaluar la diversidad genética, la estructura genética y algunos parámetros de la dinámica poblacional del cuy doméstico nativo de las regiones de Huancavelica y Junín mediante microsatélites. Se colectaron 126 individuos Huancavelica y Junín de los cuales se extrajo ADN a partir muestras de folículo piloso. Se realizaron PCR multiplex y los productos de PCR fueron separados en un secuenciador ABI 3130XL. Para los análisis se consideraron 119 individuos que presentaron ≥ 50% de marcadores genotipificados. Se utilizaron programas especializados y paquetes desarrollados en R para evaluar la genética de poblaciones. Se encontraron 186 alelos en total, en promedio 11,6 alelos por locus. Se presentaron alelos nulos en 3 de los 16 marcadores. El valor de PIC varió entre 0,47 y 0,90. La He presentó valores entre 0,54 y 0,91; mientas que la Ho estuvo entre 0,54 y 0,89. Para cada locus, la He fue mayor que la Ho en todos excepto un caso. Se encontró que 11 marcadores estaban en desequilibrio de Hardy-Weinberg, la mayoría mostró deficiencia de heterocigotos. Se encontraron 44 para de loci en desequilibrio de ligamiento. Los índices de estructuración genética fueron FST = 0,060, G’ST= 0,202 y DJ= 0,150. El AMOVA mostró que la principal fuente de variación se encuentra dentro de las localidades de muestreo (90,7%) y no entre regiones. La comparación de métodos de estructuración no pudo determinar un único valor de K (K=2-5). En las localidades se encontró un amplio flujo genético, ausencia de aislamiento por distancia, un número efectivo de una población saludable y baja endogamia. Prácticas de crianza como el préstamo de reproductores, ferias y presiones económicas y ambientales pueden contribuir a los patrones observados. Este estudio contribuiría con las políticas nacionales ambientales y podría servir como insumo para una línea base cuanto a conservación de recursos zoogenéticos.