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dc.contributor.advisorMamani Zapana, Enrique Walter
dc.contributor.advisorKreuze Rockström, Jan Frederik
dc.contributor.authorDe Souza Pacheco, Joao Adhemir
dc.date.accessioned2021-03-03T20:34:38Z
dc.date.available2021-03-03T20:34:38Z
dc.date.issued2020
dc.identifier.citationDe Souza, Joao. (2020). Caracterización molecular de un nuevo nepovirus encontrado en papa (Solanum tuberosum L.) mediante la tecnología de secuenciación profunda (Deep Sequencing). [Tesis de maestría, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Facultad de Ciencias Biológicas, Unidad de Posgrado]. Repositorio institucional Cybertesis UNMSM.
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12672/16158
dc.description.abstractSe obtuvo el genoma bipartito completo (ARN1 y ARN2) de un nuevo nepovirus que infecta a la papa, utilizando la secuenciación y ensamblaje de ARN pequeños, a lo que se le complementó con la secuenciación de Sanger. El ensamblaje de las secuencias para el ARN1 dio 7154 nts y para el ARN2 4527 nts, excluyendo la cola poli A. Cada ARN codifica para una sola poliproteína, flanqueada por regiones 5 'y 3' no traducidas (UTR), esta última seguida por una cola poli A. Las poliproteínas codificadas por el ARN1 y el ARN2 tienen conjuntos de motivos que son característicos de virus en el género Nepovirus. Se encontró que la poliproteína del ARN1 tiene los dominios para una helicasa, una proteína de unión al genoma viral, una proteinasa y una ARN polimerasa dependiente de ARN Por otro lado, la poliproteína del ARN2 tiene los dominios para la proteína de movimiento y para la cubierta proteica. Las comparaciones de secuencias usando la región Pro-Pol y la proteína de la cubierta, incluido el análisis filogenético de estas regiones, mostraron relaciones más cercanas con los nepovirus (71% y 34% de identidad en aminoácidos, respectivamente). Los datos obtenidos apoyan el estado taxonómico de este nuevo virus (llamado tentativamente Potato virus B, PVB) como miembro del género Nepovirus, subgrupo B.
dc.formatapplication/pdf
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Nacional Mayor de San Marcos
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
dc.sourceUniversidad Nacional Mayor de San Marcos
dc.sourceRepositorio de Tesis - UNMSM
dc.subjectGenomas
dc.subjectVirus - Identificación
dc.subjectVirus - Aspectos genéticos
dc.subjectVirus con ARN
dc.subjectARN polimerasas
dc.subjectPapas (Tubérculos) - Enfermedades y plagas
dc.titleCaracterización molecular de un nuevo nepovirus encontrado en papa (Solanum tuberosum L.) mediante la tecnología de secuenciación profunda (Deep Sequencing)
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/masterThesis
thesis.degree.nameMagíster en Biología Molecular
thesis.degree.grantorUniversidad Nacional Mayor de San Marcos. Facultad de Ciencias Biológicas. Unidad de Posgrado
thesis.degree.disciplineBiología Molecular
dc.subject.ocdehttps://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.02.03
dc.subject.ocdehttps://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.02
dc.subject.ocdehttps://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.03
dc.publisher.countryPE
renati.advisor.dni02414092
renati.advisor.orcidhttps://orcid.org/0000-0003-4127-1248
renati.author.dni41436466
renati.discipline511027
renati.jurorAlzamora Gonzales, Libertad
renati.jurorJara Peña, Enoc Efer
renati.jurorSandoval Peña, Gustavo Adolfo
renati.jurorRamírez Malaver, Jorge Luis
renati.levelhttps://purl.org/pe-repo/renati/level#maestro
renati.typehttps://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis
sisbib.juror.dni09022430
sisbib.juror.dni08456362
sisbib.juror.dni41020762
sisbib.juror.dni43352480


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