Maestría Facultad de Ciencias Biológicashttps://hdl.handle.net/20.500.12672/302024-03-29T08:41:06Z2024-03-29T08:41:06ZEstudio de la comunidad procariota mediante análisis de amplicones 16S rRNA de las macrocolonias de Nostoc sp. de la cuenca Culebra en Ancash, PerúQuispe Pilco, Ruth Estefanyhttps://hdl.handle.net/20.500.12672/217152024-03-15T08:04:44Z2022-01-01T00:00:00ZEstudio de la comunidad procariota mediante análisis de amplicones 16S rRNA de las macrocolonias de Nostoc sp. de la cuenca Culebra en Ancash, Perú
Quispe Pilco, Ruth Estefany
Estudia la composición bacteriana de las macrocolonias de Nostoc sp.
de los humedales de la Cuenca Culebra en Áncash (Perú).
Las macrocolonias de cianobacterias son conglomerados complejos de
microorganismos incrustados en una matriz mucilaginosa que comprende las
sustancias poliméricas extracelulares (o EPS por sus siglas en inglés) y protegida
por una capa externa. Dichas macrocolonias actúan como amortiguador contra los
cambios rápidos en la salinidad, la temperatura, la desecación y la radiación UV,
como agente aglutinante de las moléculas orgánicas esenciales y los iones para las
células, y como anclaje contra las fuerzas hidrodinámicas durante la inmersión.
Estudios en Nostoc sp., una cianobacteria filamentosa capaz de formar
macrocolonias, muestran resistencia extrema a la desecación, radiación UV y
oxidación, resaltándolo como un microorganismo capaz de adaptarse y resistir
condiciones ambientales adversas como el cambio climático, sugiriendo estrategias
fisicoquímicas, evolutivas y fisiológicas, relacionadas con los pigmentos
protectores, la toma de nutrientes y la formación de su macrocolonias. Sin embargo,
la relación que tienen estas cianobacterias con el medio que los rodea y los
microorganismos con que coexisten en su hábitat es escasa, a pesar de las
implicaciones ecológicas, como la posibilidad de ser un refugio para otros
microorganismos y otras aplicaciones biotecnológicas. Por ello, en la
investigación se realizó el estudio de las comunidades microbianas existentes
dentro de las macrocolonias de Nostoc sp., y la detección de la identidad de dicha
cianobacteria proveniente del bofedal altoandino ubicado en la Cuenca Culebra de
Ancash. El registro de dicha comunidad microbiana se hizo mediante el análisis de
amplicones 16S rRNA, identificándose a Commamonadaceae, Nostocaceae,
Paludibacteraceae, Sphingomonadaceae, Spirochaetaceae, Beijerinckiaceae,
Laptotrichiaceae, Rhodocyclaceae, Chitinophagaceae, Flavobacteriacea,
Moraxellaceae, y Hyphomicrobiaceae, como los más abundantes. Mientras que la
especie formadora de la macrocolonia es atribuida a la especie Nostoc zetterstedtii
por sus características morfológicas y a Nostoc sphaeroides y Nostoc sphaericum
basado en su localización filogenética y similitud de secuencias parciales del gen
16S rRNA.
2022-01-01T00:00:00ZVariabilidad genética de Leptospira spp mediante tipificación por secuenciación de múltiples loci (MLST) en aislamientos de la Amazonía peruana de IquitosDelgado Baldeon, Mercedes Angelicahttps://hdl.handle.net/20.500.12672/215192024-02-28T08:04:09Z2024-01-01T00:00:00ZVariabilidad genética de Leptospira spp mediante tipificación por secuenciación de múltiples loci (MLST) en aislamientos de la Amazonía peruana de Iquitos
Delgado Baldeon, Mercedes Angelica
Define la variabilidad genética y la relación filogenética de Leptospira spp
patógenas mediante el método de Tipificación de Secuenciación de Múltiples
Loci (MLST) procedentes de diferentes fuentes de aislamientos (humano,
roedor y agua) de la Amazonia peruana de Iquitos, durante el periodo 2002 al
2013.
La leptospirosis es una enfermedad zoonótica causada por bacterias del género
Leptospira, manifestándose como una epidemiología compleja y dinámica. En
estudio, la variabilidad genética y la relación filogenética entre aislados de Leptospira
spp colectados en cuatro localidades de Iquitos de la Amazonia peruana fue evaluada
mediante el método de Tipificación por Secuenciación de Múltiples Loci (MLST). Se
analizaron muestras de tres fuentes de aislamientos: de humanos, roedores y de agua,
obtenidas durante los años 2002 al 2013. Las secuencias de los genes MLST fueron
analizadas mediante la página web de MLST de Leptospira spp
(https://pubmlst.org/organisms/leptospira-spp) para la obtención del sequence type
(ST) y las secuencias concatenadas de los 7 loci de los aislados (3111 pb) fueron
alineados con el algoritmo Clustal X2 utilizando el programa MEGA X, que a su vez,
permitió la reconstrucción de un árbol filogenético mediante método de Maximum
Likelihood (ML) para determinar especies. La diversidad genética mediante el
Programa de Análisis de Polimorfismos de Secuencia de ADN (DnaSP) y la relación
genética entre los STs se determinó con el algoritmo global optimal eBURST
(goeBURST). De un total de 58 aislados peruanos de Leptospira spp, 49 fueron
patogénicos, pertenecientes a cinco especies diferentes: L. interrogans (21/49), L.
santarosai (17/49), L. noguchii (8/49), L. borgpetersenii (2/49) y L. kirschneri (1/49). Se
identificaron 21 STs, de los cuales el 62% (13/21) correspondieron a genotipos "nuevos" que circulan únicamente en el Perú. Los genotipos ST17, ST37 y ST301 se registraron tanto en roedores como en humanos. Una alta diversidad genética
intraespecífica se demostró principalmente en la especie de L. noguchi (Hd =0.933 ±
0.122). El análisis goeBURST reveló la presencia de cuatro complejos clonales (CCs)
y 15 singletons. Las nuevas variantes genéticas de Leptospira spp, no detectadas
previamente con MAT y que circulan en la Amazonia peruana, fueron registradas en
la base de datos MLST. Los STs encontrados y los índices de diversidad molecular de
L. kirchneri y L. santarosai confirmaron la ocurrencia de una alta variabilidad genética.
De acuerdo al análisis filogenético y análisis goeBURST, se determinó que los
genotipos encontrados no formaron grupos específicos según fuente de infección, ni
procedencia, lo que confirma el potencial zoonótico en una zona altamente endémica
para la leptospirosis. Este es el primer estudio de tipificación molecular MLST (basado
en 7 genes housekeeping) realizado en el Perú a partir de aislamientos de leptospiras
patógenas de diferentes fuentes y localidades de Iquitos.
2024-01-01T00:00:00ZEstudio Palinológico de 12 especies del Género: Solanum L. (Solanaceae) del valle de Chillón Prov. Canta, Dpto. LimaPrado Velazco, Ysabel Amandahttps://hdl.handle.net/20.500.12672/215172024-02-28T08:04:06Z2023-01-01T00:00:00ZEstudio Palinológico de 12 especies del Género: Solanum L. (Solanaceae) del valle de Chillón Prov. Canta, Dpto. Lima
Prado Velazco, Ysabel Amanda
Caracteriza palinológicamente el grano
de polen de 12 especies del género Solanum Linneo,1753, recolectadas en el Valle
del Rio Chillón de la provincia de Canta, del departamento de Lima (Perú), para contribuir
en la taxonomía de las especies de los Subgéneros: Solanum, Potatoe y Geminata,
así como incrementar las muestras de la Palinoteca del Departamento de
Paleontología de Invertebrados y Paleobotánica de la División Geociencias del
Museo de Historia Natural, de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos. Las
especies analizadas fueron: Solanum excisirhombeum Bitt., 1912., S.
pseudoamericanum Sarniken, Gonzales & S. Knapp, 2013, S. pentlandii Dunal,
1852., S. furcatum Dunal, 1852., S. nitidum R & P., 1799., S. amblophyllum Hook,
1831., S. basendopogon Correll, 1961., S. radicans L., 1762., S. cantense Ochoa,
1959., S. hypacrarthrum Bitter, 1912., S. huarochiriense Ochoa, 1962., y S. medians
Correll, 1961. Para su complementación se ha tomado en cuenta las especies: S.
juninense Bitter, 1916., proveniente de Cerro de Pasco y S. nigrescens Martens &
Gal., 1845. de Mérida-Venezuela, haciendo un total de 14 especies. Los granos de
polen fueron acetolizados, descritos, medidos y microfotografiados; y para
estudiarlos se utilizó el Método Acetolítico de Erdtman (1969), el más usado en
Palinología pues purifica las muestras al destruir los restos vegetales que
acompañan al polen. Con el microscopio de luz se hicieron las mediciones del eje
polar, diámetro ecuatorial, tamaño del colpo, forma y tamaño de la endoapertura,
forma del ámbito y grosor de la exina. Con el microscopio electrónico de barrido se
estudió la escultura, membrana de la exina y el índice del área polar. De los análisis
morfológicos se desprende que el género Solanum L. posee un único Tipo de polen
caracterizado por ser isopolar, radiosimétrico, trizonocolporado, colpo largo y
lalongado, tectum completo, ornamentado por gránulos redondeados de menos de
una micra de diámetro (escabrado). Los granos de polen de las especies del género
Solanum L. difieren por características morfológicas secundarias como el eje polar
(tamaño), diámetro ecuatorial, longitud del colpo, forma del grano de polen, forma
del ámbito, forma y tamaño de la endoapertura y el índice del área polar; pudiendo
estas características ser usadas en la taxonomía de las especies del género
Solanum L.
2023-01-01T00:00:00ZEvaluación de la influencia del proceso tafonómico en la obtención de ADN a partir de tejido óseo humano a través de tres metodologías de extracciónPortuguez Ramírez, Lucero Illariyhttps://hdl.handle.net/20.500.12672/214982024-02-27T08:03:39Z2023-01-01T00:00:00ZEvaluación de la influencia del proceso tafonómico en la obtención de ADN a partir de tejido óseo humano a través de tres metodologías de extracción
Portuguez Ramírez, Lucero Illariy
Determina el impacto de los factores tafonómicos (ácido, alcalino,
húmedo/fúngico) en el ADN extraído de muestras óseas antiguas,
para comparar tres métodos de extracción y evaluar la eficacia y
rendimiento de esta molécula en la investigación.
Las metodologías de extracción de la molécula de ADN, a partir de muestras óseas,
se rigen con el empleo de técnicas complejas, que con frecuencia tienen que lidiar a
diario con serios problemas como el que la muestra se encuentre degradada, la
ausencia o escasa cantidad de ADN; así como la presencia de inhibidores que
pueden ser extraídos conjuntamente con el ADN. La investigación se realizó para
comparar la eficacia de tres procedimientos de extracción de ADN, que a su vez
resulten amplificables mediante la técnica de Reacción en Cadena de la Polimerasa
(PCR por sus siglas en inglés) a partir de restos óseos antiguos. De esta manera,
se logró evaluar, comparativamente, la presencia de ADN en la muestra, los
posibles inhibidores presentes y la procedencia de las mismas para las tres
metodologías de extracción: la orgánica, la de desmineralización basada en las
aplicaciones y sugerencias de la Comisión Internacional de Personas
Desaparecidas (ICMP por sus siglas en inglés) y la metodología que utiliza el Kit de
extracción de QIAgen®. Se emplearon inicialmente 169 muestras óseas antiguas
recuperadas de fosas clandestinas, las mismas que se encontraron expuestas a
diversos medios tafonómicos, que corresponden principalmente a tres mecanismos
deteriorantes: impacto ácido, alcalino y microbiano.
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