Unidad de Posgrado Medicina Veterinaria
https://hdl.handle.net/20.500.12672/65
2024-03-28T20:38:44ZDetección y caracterización genética y patogénica de Paramixovirus aviar en poblaciones de aves silvestres y domésticas de crianza tecnificada y traspatio de Perú
https://hdl.handle.net/20.500.12672/21864
Detección y caracterización genética y patogénica de Paramixovirus aviar en poblaciones de aves silvestres y domésticas de crianza tecnificada y traspatio de Perú
Icochea D’Arrigo, Maria Eliana
Plantea un estudio con los objetivos generales de: 1) contribuir al conocimiento de la epidemiología de la enfermedad de Newcastle (ENC) en el Perú, 2) determinar si las aves silvestres son portadoras de cepas patogénicas de Paramixovirus aviar y 3) estimar el riesgo que estas representan como fuente de contaminación para las aves domésticas y de traspatio. El estudio consistió en dos ensayos; el ensayo A que tuvo como objetivos específicos: aislar, detectar y caracterizar molecularmente a los paramixovirus aviares en 22 especies de aves silvestres, residentes y migratorias de seis humedales en la costa del Perú. En el ensayo B se analizaron 21 casos de aves domésticas sospechosas de ENC, recibidos en el LPA desde el año 2004 al 2022. Diez casos procedentes de aves de riña, seis de pollos de engorde, tres de aves de postura y dos de aves de traspatio. Contrariamente a lo encontrado en aves silvestres, el secuenciamiento del gen F determinó que los diez aislados de aves de riña fueron del tipo virulento, cinco del Genotipo XII, cuatro del subgenotipo XII.1 y uno del subgenotipo VII.d; todas con IPIC de entre 1.75 a 1.85 que corresponde con los virus velogénicos viscerotrópicos. Se concluye que: 1) En el Perú existe una diversidad genética de virus, siendo los genotipos virulentos, XII y VII, con un predominio del XII, los que circulan entre las aves domésticas; 2) Que ambos genotipos XII y VII, infectan principalmente a aves de riña; y 3) Que existe una baja presencia de infección en las aves silvestres de las especies con mayor numero de muestras analizados en el presente estudio como fueron: las gaviotas (1617), cormoranes (1278), patos silvestres (946) y pelicanos (677), en las cuales se detectaron solo virus no patogénicos del genotipo I, demostrando que en el país las aves silvestres representan un riesgo menor para la industria avícola; 4) Que existe un alto grado de conservación genética entre el genotipo de los aislados peruanos y su correspondiente aislado de referencia; 5) Por último se concluye que la presentación de brotes en aves comerciales en nuestro país es consecuencia de una baja cobertura de vacunación en aves de riña y factores culturales que atentan contra la bioseguridad, habiéndose reconocido los importantes reservorios virales y tipos de virus circulantes. Los resultados obtenidos han permitido contar con un mayor conocimiento de la epidemiología de la ENC en el Perú.
2023-01-01T00:00:00ZModelo de simulación estocástica para predecir el número de cerdos infectados con la fase larvaria de Taenia solium en función del ensayo de Electro Inmunotransferencia Blot (EITB) y la edad de los animales
https://hdl.handle.net/20.500.12672/21771
Modelo de simulación estocástica para predecir el número de cerdos infectados con la fase larvaria de Taenia solium en función del ensayo de Electro Inmunotransferencia Blot (EITB) y la edad de los animales
Arroyo Hurtado, Gianfranco
Elabora un modelo de simulación estocástica para predecir la prevalencia de cisticercosis porcina mediante el análisis de EITB y la edad de los cerdos. Para la elaboración del modelo de simulación se utilizaron los resultados del diagnóstico de cisticercosis porcina mediante examen de necropsia, EITB y la edad de 421 cerdos de escenarios endémicos a T. solium. Los resultados de EITB fueron organizados como variable categórica (negativos o positivos a 1 banda; positivos a 2 o 3 bandas; positivos a 4 o más bandas); mientras que la edad de los cerdos fue organizada como variable binaria (≤8 meses; >8 meses). El diagnóstico de cisticercosis porcina mediante examen de necropsia (presencia o ausencia de quistes) fue distribuido en cada una de las combinaciones de bandas/edad del modelo en una hoja de cálculo de Excel, y posteriormente las probabilidades de infección para combinación de bandas/edad fueron ajustadas como distribuciones beta en el programa de simulaciones estocásticas @Risk 5.7 (Palisade). La validación del modelo de simulación se realizó mediante comparación entre los resultados de prevalencia observada (valores reales) y prevalencia esperada (mediante el modelo de simulación) a partir de dos estudios de cisticercosis porcina en escenarios endémicos. Para ello, la prevalencia esperada se obtuvo a partir de un ensayo de simulación beta-binomial (mediante el método de Montecarlo, 30000 iteraciones, para la cual se utilizaron las distribuciones beta previamente fijadas en el modelo). Finalmente se evaluó el modelo de simulación como herramienta de predicción, para lo cual se utilizaron los resultados de dos encuestas serológicas de cisticercosis porcina (mediante EITB) de dos escenarios endémicos. Los resultados de prevalencia esperada al 90% (mediante simulación beta-binomial; 30000 iteraciones) para ambas encuestas fueron 17.90% y 23.8% respectivamente, resultando ambas inferiores a los valores iniciales de seroprevalencia, lo que indica la sobreestimación de la infección porcina en zonas endémicas y nos permite predecir el número probable de cerdos infectados con quistes. La implementación del modelo de simulación estocástica permitirá evaluar el nivel de infección con T. solium en poblaciones porcinas para la implementación de estrategias de control y prevención de la enfermedad.
2013-01-01T00:00:00ZIdentificación de genes de resistencia bacteriana a antibióticos en restos fecales de cerdos de crianza intensiva a través de la metagenómica funcional
https://hdl.handle.net/20.500.12672/21604
Identificación de genes de resistencia bacteriana a antibióticos en restos fecales de cerdos de crianza intensiva a través de la metagenómica funcional
Marcelo Monge, Geraldine Kimberly
La resistencia a antibióticos es ya un problema actual que concierne tanto la salud humana como la salud
en general. Gran parte de estos genes de resistencia se diseminan hacia las regiones urbanas a través de
bacterias presentes en la microbiota de animales sometidos a producción intensiva, como la producción de
cerdos. Por lo que, en el presente estudio, se analiza aislados de Escherichia coli procedentes de muestras
de heces de cerdos sometidos a producción intensiva de granjas localizadas en el departamento de Lima,
específicamente de la provincia de Huaral. 87 aislados de E. coli fueron analizados por antibiograma
mediante la prueba de Kirby Bauer y mediante PCR para la identificación del gen mcr1. Posteriormente
se seleccionaron 17 aislados de E. coli en base a su multirresistencia a diversos antibióticos y a la
presencia del gen mcr1, secuenciándose un total de 17 genomas de E. coli. En estos genomas, fueron
hallados una gran cantidad y diversidad de genes de resistencia a antibióticos (ARGs), destacándose,
además del gen mcr1, relacionado con resistencia a colistina, el gen blaCTX-M-55, el cual confiere
resistencia a cefalosporinas de 3ra generación, como la ceftriaxona, un antibiótico ampliamente utilizado
en medicina humana. Otros ARGs importantes identificados en este estudio, fue el fosA3, relacionado
con resistencia a fosfomicina, diversos genes de la familia qnr, que confieren resistencia a quinolonas,
genes de la familia tet, que confieren resistencia a tetraciclinas, de la familia sul, de resistencia a
sulfonamidas y una amplia diversidad de genes de resistencia a aminoglucósidos. La información
generada resulta de vital importancia como evidencia de la diseminación de genes de gran importancia en
salud pública, debiéndose tomar medidas que eviten esta dispersión de bacterias portadoras de estos genes
a ambientes urbanos.
2023-01-01T00:00:00ZEvaluación espacio-temporal de la concentración de copias genómicas de SARS-CoV-2, HAdV, NoV GII y RV en muestras de aguas residuales urbanas no tratadas y su relación con la población de infectados en la provincia de Huancayo, región Junín
https://hdl.handle.net/20.500.12672/20837
Evaluación espacio-temporal de la concentración de copias genómicas de SARS-CoV-2, HAdV, NoV GII y RV en muestras de aguas residuales urbanas no tratadas y su relación con la población de infectados en la provincia de Huancayo, región Junín
Valdivia Carrera, César Arturo
Monitorea las aguas residuales de una ciudad de la sierra central del Perú sin planta de tratamiento de aguas residuales durante un año para evaluar la relación entre la concentración de SARS-CoV-2 y los casos reportados de COVI-19 en la comunidad.
También se evaluó la relación entre rotavirus (RV), norovirus genogrupo II (NoV GII) y adenovirus humano (HAdV) con los casos reportados de gastroenteritis aguda. Antes de iniciar el muestreo, se analizó la eficacia de recuperación de tres métodos de
procesamiento en muestras de aguas residuales inoculadas con SARS-CoV-2: análisis directo, ultrafiltración y floculación con leche desnatada. El mayor rendimiento lo obtuvo el análisis directo en comparación con la ultrafiltración y la floculación con leche
desnatada. El monitoreo de las aguas residuales reveló que el 72% (36/50) de las muestras fueron positivas a SARS-CoV-2 y el análisis directo alcanzó los mejores resultados. Además, se observó un fuerte nivel de correlación entre la concentración del SARS-CoV-2 en las aguas residuales y los casos de COVID-19, que permitió anticipar, en dos semanas, el inicio de la cuarta y quinta de la pandemia en la ciudad de Huancayo. Todas las muestras procesadas por floculación con leche desnatada fueron positivas y mostraron elevadas concentraciones de RV, NoV GGII y HAdV. Las mayores concentraciones de RV se registraron cuatro semanas antes del inicio de brotes de gastroenteritis aguda en niños menores de cuatro años. En conclusión, este estudio sugiere que el monitoreo de las aguas residuales es una excelente herramienta de vigilancia y podría anticipar brotes de enfermedades infecciosas, como la COVID-19, en países en vías de desarrollo.
2023-01-01T00:00:00Z